怎么查上下游基因（基因上游和下游怎么区分）

怎么查一个转录因子调控的下游基因

转录因子一半都结合在被调控基因的promoter区域，可以做一个chip-seq实验，然后在基因组数据库中定位这些与该转录因子结合的DNA区域.那么这些区域的下游附近的基因就很可能是受该转录因子调控的基因。

可以先预测一下该基因的promoter上潜在的转录因子结合位点。这应该有专门的软件可以分析。然后也可以做个转录因子芯片检查。没做过啊，只是看见文献上有这么做过。

转录因子被激活后通过识别特异的核苷酸序列，并与之结合，来启动和调控其靶基因的表达。

需要进行以下实验：基因表达谱分析。转录因子结合位点鉴定。转录因子与基因调控元件的相互作用。转录因子的功能分析。

克隆dna序列法 这种 *** 主要是从目标基因的启动子附近挖掘DNA序列，并 *** 成克隆体。然后在一定条件下，看是否能够驱动转录等方式来鉴定启动子。